勤怠管理システム開発は、まず労務や法令、給与などの要件を整理し、打刻から定着支援まで段階を追って進めるのが基本の流れです。
- 勤務形態・打刻・休暇・残業・権限を洗い出す
- 法令・給与・人事・既存システムとの連携の方法を決める
- テスト・移行・教育・運用・改善の計画を立てる
全体の詳しい解説は、以下の記事にまとめています。
▼全体ガイドの記事
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勤怠管理システム開発の全体像

勤怠管理システムは、従業員の出退勤時刻を記録・集計・管理するシステムです。
単なる打刻ツールにとどまらず、労務管理全般を支える基幹的な役割を担います。たとえば、残業時間の把握や有給休暇の管理、36協定の遵守状況の確認、申請承認ワークフローの運用などがあります。
働き方改革関連法の施行により、残業時間の上限規制や有給休暇取得の義務化が課せられました。そのため、正確な勤怠情報の管理は、企業にとって法的義務となっています。
システム化の主な目的は、これらの義務を確実に果たしつつ、人事担当者の集計工数を大幅に減らすことです。
勤怠管理システムが持つ主な機能
勤怠管理システムの主な機能は多岐にわたります。打刻機能では、ICカード、スマートフォンアプリ、生体認証(指紋・顔認証)などの方式に対応します。PC上のブラウザ打刻も使えるため、テレワーク環境でも正確な出退勤記録を取得できます。
勤務集計機能では、通常勤務や残業、深夜・休日勤務などの区分ごとに自動で集計し、法定労働時間をどれだけ超えているかを、リアルタイムで把握できます。申請承認ワークフロー機能では、遅刻や早退、残業、休暇(有給・特別休暇・育児介護休業など)の申請をオンラインで完結させ、上長の承認を経て勤怠データに反映します。
36協定管理機能では、従業員ごとの時間外労働の累積を追跡し、上限に近づいた場合にアラートを通知します。また、給与計算システムや人事システムとのデータ連携も欠かせません。月次の勤怠データを自動で連携することで、給与計算の正確性と効率を高められます。
開発工程の全体フローと期間目安
勤怠管理システム開発の標準的な工程は、業務ヒアリング・現状分析(1〜2ヶ月)、要件定義・機能設計(1〜2ヶ月)、基本設計・詳細設計(1〜2ヶ月)の順に進みます。そのあとに、開発・単体テスト(2〜4ヶ月)、結合テスト・ユーザー受け入れテスト(1〜2ヶ月)、移行・リリース・定着支援(1〜2ヶ月)が続きます。
勤務形態の種類が少なく比較的シンプルなシステムなら合計4〜6ヶ月、多様な勤務形態や複数拠点への対応が必要なら6〜12ヶ月が目安です。
既存の紙やExcel管理からのデータ移行や、既存の給与計算システム・人事システムとのAPI連携開発が伴う場合は、さらに工数が増えます。また、月次の給与締め処理に間に合わせるリリーススケジュールも、重要な考慮事項です。
勤怠管理システム開発の進め方(フェーズ別解説)

勤怠管理システム開発を進めるには、各フェーズで「何を決めるのか」「誰が関わるのか」を押さえておくことが欠かせません。特に要件定義では、多様な勤務形態や複雑な就業規則、法令要件を正確に把握できるかどうかで、後工程の品質が大きく変わります。
業務ヒアリング・現状分析(As-Is整理)
開発の第一歩は、現在の勤怠管理がどのように行われているかを正確に把握することです。人事担当者、現場管理職、一般従業員それぞれへのヒアリングを通じて、現行の打刻方法や承認フローを、集計作業の実態や発生している課題と合わせて整理します。特に重要なのは、就業規則の内容を詳細に確認することです。
フレックスタイム制やシフト制、裁量労働制、テレワーク勤務など、複数の勤務形態が混在する場合は、それぞれのルールと例外処理を漏れなく整理します。また、現行の給与計算システムや人事システムのデータ形式と連携仕様は、後工程の設計ミスを防ぐために早い段階で確認しておきます。
As-Is整理では、業務フロー図、課題一覧、要件候補リストを作成します。これらは、次の要件定義フェーズへの出発点になります。
要件定義・機能設計(To-Be設計)
As-Is整理をもとに、システム化後の理想の業務フローと必要な機能を定義します。機能要件では、打刻方式(ICカード・スマートフォン・生体認証・PC打刻)の種類と対応範囲、勤務区分(所定内労働・時間外・深夜・休日)の定義を決めます。
申請承認ワークフローの種類と承認ルートや、有給休暇取得率の自動集計、36協定のアラート基準と通知先も、同じ段階で定めます。給与計算システム・人事システムへのデータ連携仕様も、この段階で決めます。
非機能要件では、マルチデバイス対応(PC・スマートフォン・タブレット)や、クラウド型かオンプレミス型かの選択を定めます。また、同時接続数・レスポンスタイム・稼働率の基準と、セキュリティ要件(個人情報保護・アクセスログ・暗号化)も定義します。要件定義書は、人事部門・経営層・IT部門が揃って承認する正式なドキュメントとして位置づけます。
開発・テスト・リリース・定着支援
設計が固まったら、開発フェーズに進みます。勤怠管理システムでは、勤務区分の計算ロジック(残業時間の判定・深夜割増・休日割増)が特に複雑になりやすいため、具体的なケースを事前に洗い出して仕様に落とし込みます。
テストでは、単体テスト(打刻ロジック・計算ロジックの正確性確認)、結合テスト(申請承認ワークフローの動作確認・給与システム連携の確認)、ユーザー受け入れテスト(実際の従業員による操作確認)の順に実施します。そのうえで、リリース前には月次締め処理のシミュレーションを行い、給与計算結果が正確に出力されるかを検証します。
リリース後の定着支援として、操作マニュアル・FAQの整備、従業員向けトレーニング、ヘルプデスク対応が欠かせません。とくに全従業員が使うシステムなので、現場の混乱を抑える丁寧なサポートが、長く使われる状態を支えます。
要件定義のポイントと注意事項

勤怠管理システムの要件定義は、労働法令に沿う観点から精緻に進める必要があります。「とりあえず打刻できればよい」と考えて進めると、法令違反のリスクや、後工程での大規模な仕様変更を招きます。
要件定義フェーズでは、勤務形態、労働法令、給与・人事システムとの連携を、特に丁寧に確認します。
勤務形態の種類の網羅的な整理
勤怠管理システムの要件定義で最も重要な作業の一つは、自社にあるすべての勤務形態を網羅的に整理することです。標準的な9時〜18時の固定時間制だけでなく、コアタイムのあるフレックスタイム制や、コアタイムなしの完全フレックス制もあります。
さらに、シフト制(複数のシフトパターン)、裁量労働制(みなし労働時間制)、高度プロフェッショナル制度もあります。制度ごとに時間外労働の計算方法や承認フローが違うため、それぞれ整理しておく必要があります。
テレワーク・在宅勤務の扱い(通常勤務と同じ扱いか否か)、出張時の移動時間の扱い、複数事業場を移動する従業員の打刻方法も、事前に決めておく必要があります。勤務形態ごとに「どのルールが適用されるか」「例外処理はどう対応するか」を整理しておくと、設計・開発の精度を高められます。
労働基準法・働き方改革対応要件の確認
勤怠管理システムは労働法令に沿って動く必要があり、とくに残業時間の上限規制と有給休暇の取得義務には、システムでの対応が必要です。残業時間の上限規制(原則は月45時間・年360時間、特別条項でも月100時間未満・年720時間以内)に対するアラート機能は必須です。システムが上限に近づいた従業員を自動で検出し、管理者に通知する仕組みも求められます。
有給休暇の取得義務化(年10日以上付与される従業員に年5日取得させる義務)に対しては、取得状況の自動集計と期限管理アラートが必要です。また、36協定では、協定で締結した限度時間を超えないよう監視し、超過のおそれがある従業員を事前に把握できる機能が求められます。
法令要件は定期的に改正されるため、法改正に継続的に対応できる保守体制も、要件定義の段階から含めておく必要があります。
給与計算・人事システムとの連携設計
勤怠管理システムは、給与計算システムや人事システムとのデータ連携が欠かせません。連携設計を後回しにすると、月次締めで手作業のデータ転記が残ってしまい、システム化のメリットが大きく損なわれます。
要件定義の段階では、連携先システムの種類(給与計算パッケージ・クラウド型人事システム・社内独自システム)と、そのAPI仕様やデータ形式(CSV・API連携・EDI)を調べておきます。連携タイミング(月次一括連携・リアルタイム連携)と連携項目(勤務時間・残業時間・欠勤日数・有給取得日数など)も、明確に定めます。
とくに給与計算システムと勤怠管理システムの間では、勤務区分の定義や計算ロジックに食い違いが生じないよう、両システムの担当者が同席してすり合わせを行うことを強くおすすめします。
開発方式の選択(スクラッチ vs パッケージカスタマイズ)
勤怠管理システムの構築手段は、スクラッチ開発・パッケージソフトのカスタマイズ・クラウド型SaaSの活用・ノーコードツールの活用などに大別されます。
自社の就業規則の複雑さや予算、開発期間、保守体制を合わせて考え、どの手段が最適かを選びます。
スクラッチ開発が適しているケース
スクラッチ開発は、自社固有の就業規則や複雑な勤務形態、独自の計算ロジックを持つ企業に適しています。たとえば、業種特有のシフトパターンを持つ企業(24時間365日対応の医療・介護・警備など)や、複数の雇用形態が混在する企業、海外拠点と連携する企業などがあります。こうした企業では、汎用パッケージでは対応しきれないケースが多く、スクラッチ開発が選ばれます。
また、既存の独自システム(生産管理・販売管理など)との密な連携が必要な場合もスクラッチ開発の優位性が発揮されます。一方で、開発コストと期間は他の手段より大きくなるため、「パッケージカスタマイズでは本当に対応できないか」を慎重に検討してから判断します。
パッケージ・SaaSカスタマイズが適しているケース
勤怠管理は法令準拠が求められる汎用性の高い業務であるため、クラウド型SaaS(KING OF TIME・ジョブカン・マネーフォワードHRなど)やパッケージソフトが多く普及しています。また、標準的な勤務形態(固定時間・フレックス)への対応や、有給管理・残業管理などの基本機能が充実しており、初期コストを抑えながら短期間での導入が可能です。
クラウド型SaaSのメリットとして、法改正への自動対応、インフラ管理の不要、マルチデバイス対応が標準で提供される点が挙げられます。ただし、自社固有の特殊な就業規則や計算ロジックには、対応に限界があることも少なくありません。そのため、パッケージの標準機能で対応できない要件をどう扱うかを、事前に確認しておく必要があります。
スクラッチ開発と比べてコストと期間を大幅に抑えられるので、まずはパッケージでの対応可否を検討することをおすすめします。
クラウド型とオンプレミス型の選択基準
勤怠管理システムの基盤には、クラウド型(インターネット経由でサービスを利用)とオンプレミス型(自社サーバーにシステムを構築)があり、どちらを選ぶかは大きな判断になります。
クラウド型は初期費用が低く、インフラ管理が不要で、テレワーク環境にも対応しやすいため、近年の主流となっています。従業員がスマートフォンやタブレットから場所を問わず打刻できることも、大きなメリットです。テレワーク普及の観点でも、クラウド型は圧倒的に有利です。
一方、オンプレミス型は、社内ネットワーク内でのみ稼働するため、高いセキュリティを確保しやすい方式です。個人情報保護の観点からクラウドへのデータ預けに制約がある業種(官公庁・医療機関・金融機関など)では、オンプレミス型が選ばれるケースがあります。そのうえで、セキュリティ要件との兼ね合いを慎重に判断します。
よくある失敗とその回避策
勤怠管理システム開発の失敗は、多くの場合、「就業規則の確認不足」「連携先システムとの仕様の食い違い」「現場の使いやすさへの配慮不足」という三つの原因にまとまります。これら三つの原因を事前に把握し、それぞれに対策を講じておくことが、プロジェクトの成功確率を高めます。
就業規則・例外処理の確認不足
勤怠管理システム開発で最も多い失敗の一つは、就業規則に定められたルールを開発開始前に完全には把握していなかったケースです。就業規則は本則だけでなく、別規程・付則・労使協定なども含めて確認する必要があります。
特に、「遅刻した場合の端数処理ルール」「深夜残業が翌日の所定内労働時間と重なった場合の扱い」「有給休暇の時間単位取得への対応」などの例外処理があります。介護休業・育児休業の残余日数計算や特別休暇の計算ルールを含め、これらを網羅しないと、リリース後に「実際の給与計算と結果が合わない」という致命的な問題が起きます。
回避策としては、要件定義フェーズで社会保険労務士や労務経験のある担当者を交えてレビューを行うことが有効です。そのうえで、就業規則上のすべての計算パターンを、テストケースに落とし込みます。
給与システム連携の設計ミス
勤怠管理システムと給与計算システムの連携設計を後工程に回した結果、両システムの勤務区分の定義が食い違い、大規模な修正が必要になったケースは多くあります。たとえば、勤怠システムでは「所定外残業」と「法定外残業」を区別して集計しています。一方、給与システム側では「残業計」としか受け取れない仕様になっていた場合、連携データの形式変換に予想外の工数が発生します。
回避策として、要件定義の段階から給与計算システムのデータ仕様を詳しく確認します。また、連携項目・データ形式・連携タイミングは、両システムの担当者がそろった場で合意しておくことが欠かせません。
新旧システムの並行稼働期間を設けて、データの突合確認を行います。給与計算結果が正確に一致するかを、本番前に必ず検証しておきます。
現場の使いやすさへの配慮不足
勤怠管理システムは全従業員が毎日使うため、UIの使いやすさが定着率に直結します。「打刻ボタンがわかりにくい」「申請フローが複雑すぎる」「スマートフォンでの操作性が悪い」といった問題は、現場の抵抗を生みます。その結果、「打刻漏れ」「紙の申請と並行運用」という状態に陥るケースがあります。
回避策として、開発前にプロトタイプ(画面モック)を作成し、現場の代表者に操作してもらう確認の場を必ず設けます。特にシフト勤務の現場では、スマートフォンやタブレットでの操作が主体になるため、マルチデバイス対応と直感的なUI設計を重点的に検討してください。
打刻忘れの通知や申請期限のリマインドなど、従業員が漏れなく操作できるサポート機能も検討したいところです。
勤怠管理システム開発の相談先(ripla)
riplaは、コンサルティングから開発まで一気通貫で支援できる勤怠管理システム開発会社です。
就業規則の分析から要件定義、設計・実装までを担当します。給与システム連携や定着支援まで含めて、プロジェクト全体を一貫して支えます。
働き方改革への対応や多様な勤務形態への対応、マルチデバイス対応など、勤怠管理システムに求められる要件を熟知したメンバーが上流から関わり、現場に根付くシステムの実現をご支援します。
▼RFP作成前に読みたい無料ホワイトペーパー
・業務システム開発の完全ガイドブック
・スクラッチシステム開発の完全ガイドブック
・【2026年最新版】AI駆動開発の完全ガイドブック
会社紹介
株式会社riplaでは、お客様の事業・ユーザー・業務に最適化したオーダーメイド型システムを、構想策定・要件定義から開発・改善まで一気通貫で支援。事業会社でIT・DXを経験したプロフェッショナルによる高い要件定義力・システム設計力を活かし、事業成果の最大化に伴走します。

また、当社独自の開発テンプレート「Boxシリーズ」による標準機能の高速開発と、AI駆動開発の独自フレームワーク「GoDD」による独自機能のAI実装を組み合わせることで、低コスト・短期間で開発を実現いたします。

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株式会社ripla 代表取締役CEOとして、システムパッケージ活用、システム開発、データ分析、生成AI活用、SaaS開発、アプリ開発、EC構築など、幅広い領域で企業のDX推進と事業成長を支援している。事業会社でIT・DXを経験したプロフェッショナルが集う株式会社riplaにおいて、お客様の事業・ユーザー・業務に最適化したオーダーメイド型システムを構想策定・要件定義から開発・改善まで一気通貫で支援し、単なるシステム納品にとどまらず、クライアントと同じ目線で事業成果の最大化に向けた伴走支援を行う。早稲田大学卒業後、ラクスル株式会社、LINEヤフー株式会社にて事業開発やDX推進などに従事した後、株式会社riplaを創業。
